Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn6O35454 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn6O35454 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms