Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf5O35326 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srsf5O35326 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf5O35326 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms