Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pkd2O35245 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pkd2O35245 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pkd2O35245 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pkd2O35245 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pkd2O35245 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pkd2O35245 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pkd2O35245 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Pkd2O35245 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pkd2O35245 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms