Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnih2O35089 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih2O35089 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih2O35089 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnih2O35089 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnih2O35089 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnih2O35089 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms