Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EllO08856 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EllO08856 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EllO08856 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EllO08856 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EllO08856 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EllO08856 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EllO08856 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EllO08856 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EllO08856 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EllO08856 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EllO08856 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EllO08856 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EllO08856 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EllO08856 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EllO08856 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EllO08856 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EllO08856 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EllO08856 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EllO08856 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EllO08856 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EllO08856 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EllO08856 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EllO08856 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EllO08856 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EllO08856 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EllO08856 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EllO08856 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EllO08856 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EllO08856 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EllO08856 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EllO08856 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EllO08856 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EllO08856 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EllO08856 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EllO08856 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EllO08856 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EllO08856 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EllO08856 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EllO08856 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EllO08856 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EllO08856 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EllO08856 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EllO08856 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EllO08856 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EllO08856 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EllO08856 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EllO08856 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EllO08856 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EllO08856 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EllO08856 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EllO08856 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EllO08856 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EllO08856 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EllO08856 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EllO08856 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EllO08856 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EllO08856 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EllO08856 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EllO08856 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EllO08856 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EllO08856 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EllO08856 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EllO08856 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EllO08856 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EllO08856 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EllO08856 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EllO08856 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EllO08856 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EllO08856 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EllO08856 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EllO08856 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EllO08856 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EllO08856 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EllO08856 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EllO08856 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EllO08856 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EllO08856 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EllO08856 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EllO08856 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EllO08856 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EllO08856 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EllO08856 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EllO08856 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EllO08856 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EllO08856 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EllO08856 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EllO08856 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EllO08856 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EllO08856 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EllO08856 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EllO08856 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EllO08856 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EllO08856 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EllO08856 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EllO08856 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EllO08856 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EllO08856 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EllO08856 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EllO08856 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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