Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IfnabL7MTU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IfnabL7MTU6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IfnabL7MTU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms