Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smim18J3QNP2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim18J3QNP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim18J3QNP2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms