Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17577J3QNF7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17577J3QNF7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17577J3QNF7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17577J3QNF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17577J3QNF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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