Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34c3J3QJW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c3J3QJW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c3J3QJW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms