Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r194J3JS27 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r194J3JS27 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r194J3JS27 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r194J3JS27 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms