Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pot1bH7BX60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pot1bH7BX60 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pot1bH7BX60 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pot1bH7BX60 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pot1bH7BX60 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms