Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pcf11G3X9Z4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pcf11G3X9Z4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pcf11G3X9Z4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pcf11G3X9Z4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pcf11G3X9Z4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pcf11G3X9Z4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms