Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Pnmal2G3X9N3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pnmal2G3X9N3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pnmal2G3X9N3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pnmal2G3X9N3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pnmal2G3X9N3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pnmal2G3X9N3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms