Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zkscan2G3X952 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zkscan2G3X952 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zkscan2G3X952 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zkscan2G3X952 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zkscan2G3X952 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms