Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34aG3UW52 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34aG3UW52 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn34aG3UW52 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms