Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG4

H2-T24, Histocompatibility 2, T region locus 24, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T24F8VQG4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-T24F8VQG4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-T24F8VQG4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2-T24F8VQG4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2-T24F8VQG4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-T24F8VQG4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.9 ms