Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5624F6ZZG8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm5624F6ZZG8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5624F6ZZG8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5624F6ZZG8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5624F6ZZG8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms