Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1700113H08RikE9Q9Q5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1700113H08RikE9Q9Q5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
1700113H08RikE9Q9Q5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
1700113H08RikE9Q9Q5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
1700113H08RikE9Q9Q5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
1700113H08RikE9Q9Q5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700113H08RikE9Q9Q5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms