Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Aldh3b2E9Q3E1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aldh3b2E9Q3E1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aldh3b2E9Q3E1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms