Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krtap11-1E9Q2E9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krtap11-1E9Q2E9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms