Protein–RNA interactions for Protein: E9Q101

Gm6034, Predicted gene 6034, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6034E9Q101 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6034E9Q101 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6034E9Q101 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6034E9Q101 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm6034E9Q101 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms