Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930426L09RikE9Q0N7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930426L09RikE9Q0N7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930426L09RikE9Q0N7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms