Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5415E9PXF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5415E9PXF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5415E9PXF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5415E9PXF3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5415E9PXF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5415E9PXF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms