Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clca3bE9PUL3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clca3bE9PUL3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clca3bE9PUL3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clca3bE9PUL3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clca3bE9PUL3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca3bE9PUL3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms