Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc8D3YZV8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc8D3YZV8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc8D3YZV8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms