Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf1D3YY23 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf1D3YY23 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf1D3YY23 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms