Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc170D3YXL0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc170D3YXL0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc170D3YXL0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc170D3YXL0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc170D3YXL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc170D3YXL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms