Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol6B7ZC55 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol6B7ZC55 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol6B7ZC55 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol6B7ZC55 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol6B7ZC55 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol6B7ZC55 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol6B7ZC55 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms