Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018F24RikB2RW27 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
1700018F24RikB2RW27 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700018F24RikB2RW27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700018F24RikB2RW27 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018F24RikB2RW27 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms