Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbed5B2RPU8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed5B2RPU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed5B2RPU8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed5B2RPU8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms