Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem238A9JSM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem238A9JSM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms