Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Herc3A6H6S0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc3A6H6S0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Herc3A6H6S0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Herc3A6H6S0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Herc3A6H6S0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms