Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc38A3KMP2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc38A3KMP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc38A3KMP2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc38A3KMP2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc38A3KMP2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc38A3KMP2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc38A3KMP2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc38A3KMP2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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