Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5640A3KG49 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5640A3KG49 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5640A3KG49 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5640A3KG49 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms