Protein–RNA interactions for Protein: A2AWL3

AV320801, Expressed sequence AV320801, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AV320801A2AWL3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AV320801A2AWL3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
AV320801A2AWL3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
AV320801A2AWL3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AV320801A2AWL3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AV320801A2AWL3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms