Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll9A2APC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttll9A2APC3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll9A2APC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttll9A2APC3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms