Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc183A2AJB1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc183A2AJB1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc183A2AJB1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc183A2AJB1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms