Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc163A2AGD7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc163A2AGD7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc163A2AGD7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc163A2AGD7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms