Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700023F06RikA2AB62 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700023F06RikA2AB62 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
1700023F06RikA2AB62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms