Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVP8

Gm5580, Predicted pseudogene 5580, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5580A0A0N4SVP8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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