Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms