Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRU1

CN725425, cDNA sequence CN725425, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CN725425A0A087WRU1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CN725425A0A087WRU1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CN725425A0A087WRU1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CN725425A0A087WRU1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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CN725425A0A087WRU1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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CN725425A0A087WRU1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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CN725425A0A087WRU1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CN725425A0A087WRU1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CN725425A0A087WRU1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CN725425A0A087WRU1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CN725425A0A087WRU1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CN725425A0A087WRU1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CN725425A0A087WRU1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CN725425A0A087WRU1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CN725425A0A087WRU1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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CN725425A0A087WRU1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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CN725425A0A087WRU1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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CN725425A0A087WRU1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CN725425A0A087WRU1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CN725425A0A087WRU1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CN725425A0A087WRU1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CN725425A0A087WRU1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CN725425A0A087WRU1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CN725425A0A087WRU1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CN725425A0A087WRU1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CN725425A0A087WRU1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CN725425A0A087WRU1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CN725425A0A087WRU1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms