Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbv4A0A075B5I2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trbv4A0A075B5I2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbv4A0A075B5I2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trbv4A0A075B5I2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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