RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 TEX35Q5T0J7 233 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 ASPGQ86U10 573 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 RNF139Q8WU17 664 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 EXTL1Q92935 676 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 WBP2Q969T9 261 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 RAD9AQ99638 391 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CARD6Q9BX69 1037 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 RAB17Q9H0T7 212 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 RAB9BQ9NP90 201 aa5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 A0A0G2JK05 382 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 A0A1W2PP11 408 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 DENND3A2RUS2 1198 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 FAM149AA5PLN7 773 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 TARM1B6A8C7 271 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CXCL11O14625 94 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 SSX5O60225 188 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 PEX11BO96011 259 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 GSRP00390 522 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 C9P02748 559 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 KRT5P13647 590 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 NR1D1P20393 614 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 AKT2P31751 481 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 HSD17B3P37058 310 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 TAS2R38P59533 333 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 GPM6BQ13491 265 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 PTGISQ16647 500 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 FAM153CQ494X1 144 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 DCAF6Q58WW2 860 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 C18orf63Q68DL7 685 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 SLC36A4Q6YBV0 504 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 KIAA0895Q8NCT3 520 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 TMEM163Q8TC26 289 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 ELP5Q8TE02 316 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CKAP2Q8WWK9 683 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 SMPDL3BQ92485 455 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 THRSPQ92748 146 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 HAS1Q92839 578 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 P2RX5Q93086 422 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 COQ10AQ96MF6 247 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CNGB3Q9NQW8 809 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 NPAP1Q9NZP6 1156 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 FAM153AQ9UHL3 310 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CCDC169A6NNP5 214 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CLDN3O15551 220 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 LANCL1O43813 399 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 HSF2BPO75031 334 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 RAD51DO75771 328 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 PIK3R1P27986 724 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 PTGS2P35354 604 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 METAP1P53582 386 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 C21orf58P58505 322 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 FOXM1Q08050 763 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 ST3GAL1Q11201 340 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 OVGP1Q12889 678 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 NPTX1Q15818 432 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 GRTP1Q5TC63 336 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 Q6YL49 198 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 FAM57BQ71RH2 274 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 BMPERQ8N8U9 685 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 OR2T34Q8NGX1 318 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 FAM213AQ9BRX8 229 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 RAB33BQ9H082 229 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.75□□□□□ -1.49
MDM2-201ENST00000258148 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms