RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520961.1

RBM12B-206, Transcript of RNA binding motif protein 12B, human

TSL 3

Gene RBM12B, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM12B-206	ENST00000520961	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	UGP2	Q16851	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	NXPH2	O95156	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ZWINT	O95229	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CLDN1	O95832	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	GABRA5	P31644	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	HERV-K104	P61576	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SIRPA	P78324	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CDK3	Q00526	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DRP2	Q13474	957 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	NR1D2	Q14995	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	E2F5	Q15329	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961		B4DLN1	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	VILL	O15195	856 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DFFB	O76075	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SLC15A1	P46059	708 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CSRP3	P50461	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	GSDMD	P57764	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	HLA-B	Q31612	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF195	O14628	629 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PSMB10	P40306	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	HNF4A	P41235	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	GRAP	Q13588	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MED24	O75448	989 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	WDPCP	O95876	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	ACADS	P16219	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	SHC1	P29353	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	ACSL1	P33121	698 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	KRT12	Q99456	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM12B-206	ENST00000520961	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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