RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TPBGLP0DKB5 382 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CCR10P46092 362 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 NFATC3Q12968 1075 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ABRQ12979 859 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 DNASE1L3Q13609 305 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TMED2Q15363 201 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CASC4Q6P4E1 433 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC6Q86X45 466 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CT55Q8WUE5 264 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PANX3Q96QZ0 392 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 P2RY12Q9H244 342 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 KALRNO60229 2985 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM63AO94886 807 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SLCO2B1O94956 709 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RPN2P04844 631 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 UGT2B7P16662 529 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 POLE2P56282 527 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ERV3-1Q14264 604 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM73Q86UV7 250 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 OR2A14Q96R47 310 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SNX12Q9UMY4 172 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SPTA1P02549 2419 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PCM1Q15154 2024 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ISM1B1AKI9 464 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 C21orf140B9A014 251 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 KPNA5O15131 536 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PFDN6O15212 129 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF185O15231 689 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PHF2O75151 1096 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MSL3P1P0C860 447 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MLNP12872 115 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PLA2G2AP14555 144 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PAMP19021 973 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ARMC3Q5W041 872 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MCUQ8NE86 351 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 OR1L3Q8NH93 324 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GRK7Q8WTQ7 553 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 STARD5Q9NSY2 213 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF462Q96JM2 2506 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0J9YY10 115 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CES2O00748 559 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CREG1O75629 220 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP2A7P20853 494 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PKLRP30613 574 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FMO4P31512 558 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FNTAP49354 379 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB28P51157 221 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GPS2Q13227 327 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNAB2Q13303 367 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 KYNUQ16719 465 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 LPGAT1Q92604 370 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms