RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 CHRNA1P02708 482 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 KHKP50053 298 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 MAPK10P53779 464 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ARMC3Q5W041 872 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 SVOPLQ8N434 492 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 DUSP26Q9BV47 211 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 PRPS1L1P21108 318 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 CAPGP40121 348 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 PTPN5P54829 565 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 MAPK11Q15759 364 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 RPTNQ6XPR3 784 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 NUDT13Q86X67 352 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 FAM47BQ8NA70 645 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 HAS3O00219 553 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 PGM3O95394 542 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 TNFP01375 233 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 KRT77Q7Z794 578 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 XKRYO14609 159 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 HDDC2Q7Z4H3 204 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 HMGB4Q8WW32 186 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 U3KQV3 271 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 OR51F1A6NGY5 319 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 KLK6Q92876 244 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 ACP5P13686 325 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 HSPB3Q12988 150 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 DUXAA6NLW8 204 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ALDH4A1P30038 563 aa16.73■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 NFKB2Q00653 900 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 TCEAL5Q5H9L2 206 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ABI3Q9P2A4 366 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.73■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.73■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 SOCS5O75159 536 aa16.73■□□□□ 0.27
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NISCH-213ENST00000489895 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 MASP1P48740 699 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G16P53816 162 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 EIPR1Q53HC9 387 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 PIGXQ8TBF5 258 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 SMPDL3AQ92484 453 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 SHISA4Q96DD7 197 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 TMEM209Q96SK2 561 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 GPR22Q99680 433 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 KIFC1Q9BW19 673 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ECI2O75521 394 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 MPIP34949 423 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 MED22Q15528 200 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 IFI44LQ53G44 452 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 SPIN4Q56A73 249 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 LMO3Q8TAP4 145 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-213ENST00000489895 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
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