RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.33■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.33■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.33■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.33■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 BFARQ9NZS9 450 aa22.33■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 NTRK1P04629 796 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PLA2G2AP14555 144 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PVRP15151 417 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 CDK16Q00536 496 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 GPS1Q13098 491 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 BORAQ6PGQ7 559 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 KRT222Q8N1A0 295 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 MFSD3Q96ES6 412 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PBKQ96KB5 322 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 KIFC1Q9BW19 673 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.32■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 AVILO75366 819 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 KRT14P02533 472 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 MAGEA6P43360 314 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 ZNF605Q86T29 641 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 SLC35F6Q8N357 371 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 MPP5Q8N3R9 675 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 COG1Q8WTW3 980 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 CT55Q8WUE5 264 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 CARD6Q9BX69 1037 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 P2RY12Q9H244 342 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 LHX9Q9NQ69 397 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PADI1Q9ULC6 663 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 COL6A6A6NMZ7 2263 aa22.31■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 C2orf74A8MZ97 194 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 B8ZZF3 427 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 AP3B1O00203 1094 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TMEM63AO94886 807 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TTPAP49638 278 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 NFATC3Q12968 1075 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 ABRQ12979 859 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 CYP1B1Q16678 543 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 C16orf46Q6P387 395 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TRIM73Q86UV7 250 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 CATSPER2Q96P56 530 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 RUFY1Q96T51 708 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 KCND1Q9NSA2 647 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 SOX13Q9UN79 622 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.3■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 GPC4O75487 556 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 SCRG1O75711 98 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 VAPBO95292 243 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 MT-ND3P03897 115 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TCN2P20062 427 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 SHMT2P34897 504 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 POLE2P56282 527 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 DNASE1L3Q13609 305 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 TMEM126BQ8IUX1 230 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 OR8K5Q8NH50 307 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 CPT1BQ92523 772 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 STARD5Q9NSY2 213 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 POLG2Q9UHN1 485 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 ZNF462Q96JM2 2506 aa22.29■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PIPSLA2A3N6 862 aa22.28■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 F8W8V4 182 aa22.28■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PSME4-208ENST00000481518 KATNA1O75449 491 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms