RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMD3O43242 534 aa25.44■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS18P62269 152 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNG1Q06432 222 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPA4Q13156 261 aa25.44■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHC3Q8NDX5 983 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALS2CR12Q96Q35 445 aa25.44■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THAP4Q8WY91 577 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPT1BQ92523 772 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM121Q9BTD3 319 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYTL2Q9HCH5 934 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTN3A3O00478 584 aa25.42■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K7O43318 606 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP2A2O94973 939 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PREPP48147 710 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSDMDP57764 484 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA5AQ13591 1074 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBN1Q16643 649 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COLEC12Q5KU26 742 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASB18Q6ZVZ8 466 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX19Q8NA77 164 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC38A9Q8NBW4 561 aa25.42■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN13Q12923 2485 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKG2Q13237 762 aa25.41■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IZUMO3Q5VZ72 239 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00523Q86TU6 105 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMIGO1Q86WK6 493 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRTNQ99748 197 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DESI2Q9BSY9 194 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HGH1Q9BTY7 390 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITPNM3Q9BZ71 974 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBASA2RRP1 2371 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.4■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MROH6A6NGR9 719 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf74A8MZ97 194 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEN1O00255 615 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST6GAL1P15907 406 aa25.4■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM139Q8IV31 216 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1L3Q8NH93 324 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLIP3Q96DZ5 547 aa25.4■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0U1RQJ8 604 aa25.39■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJB5O75953 348 aa25.39■■□□□ 1.66
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2A7P20853 494 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMA3P25788 255 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITIH4Q14624 930 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSELQ8IZU8 1212 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HES6Q96HZ4 224 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM55Q9BYV6 548 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERTAD3Q9UJW9 196 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL12A1Q99715 3063 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa25.38■■□□□ 1.65
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