RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa22.43■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 UBXN4Q92575 508 aa22.43■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 PPM1MQ96MI6 270 aa22.43■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.43■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.43■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.43■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.43■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa22.43■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 AP2A2O94973 939 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 FGF5P12034 268 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 FOLR1P15328 257 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 NSG1P42857 185 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 IL11RAQ14626 422 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 PACS1Q6VY07 963 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 OOSP2Q86WS3 158 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 PRELID2Q8N945 189 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 EXD3Q8N9H8 876 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.42■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 TLCD2A6NGC4 264 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 OR1I1O60431 355 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 TIAF1O95411 115 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 ITGB2P05107 769 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 NDUFS1P28331 727 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 KRT33BQ14525 404 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 SEMA3AQ14563 771 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 PHC3Q8NDX5 983 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 OR4E2Q8NGC2 313 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 FERD3LQ96RJ6 166 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 CD180Q99467 661 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 KALRNO60229 2985 aa22.41■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 EBLN1P0CF75 366 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 CD151P48509 253 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 CRADDP78560 199 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 ABHD18Q0P651 414 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 RPA4Q13156 261 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 LAMB3Q13751 1172 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 TBR1Q16650 682 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 MED8Q96G25 268 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 IL17BQ9UHF5 180 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.4■■□□□ 1.18
PSME4-208ENST00000481518 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 SPAG6O75602 509 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 KIAA0754O94854 1291 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 GSTM1P09488 218 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 STAT5AP42229 794 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 GSTM4Q03013 218 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 TUBB3Q13509 450 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 MAP7Q14244 749 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 BRD3Q15059 726 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 OR4L1Q8NH43 312 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 LCN9Q8WX39 176 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 ELMO1Q92556 727 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 HGH1Q9BTY7 390 aa22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 NRDCO43847 1150 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 FTH1P02794 183 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 FAM87AP0C7U9 286 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 F8A1P23610 371 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 PRKG2Q13237 762 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 13.2
PSME4-208ENST00000481518 ARMC6Q6NXE6 501 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 KMT5CQ86Y97 462 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 ESX1Q8N693 406 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.173e-7■■■□□ 17.4
PSME4-208ENST00000481518 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 SRMSQ9H3Y6 488 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 MVB12BQ9H7P6 319 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.38■■□□□ 1.17
PSME4-208ENST00000481518 POMT2Q9UKY4 750 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms